二氧化碳是水中存在较多的杂质，通常情况下是以游离状态存在；水中存在的大量碳酸氢根在pH低时，也是以二氧化碳游离状态存在的。于是产生了碳酸平衡问题，反应式如下：

CO₂+H₂O=H⁺+HCO₃^-=2H⁺+CO₃^2-

因此，水中二氧化碳越多，生成H+越多，水的pH值越低，产生酸性的腐蚀性水，破坏了碳钢表面生成的保护膜引起碳钢腐蚀。其腐蚀的化学反应如下：

2CO₂+Fe(OH)₂=Fe(HCO₃)₂

4Fe(HCO₃)₂+O₂+2H₂O=4Fe(OH)₃+8CO₂

如果除盐水中进入二氧化碳，水的电导率即会上升，腐蚀性增大。因此除盐水箱应当有防止大气中二氧化碳溶入水箱的措施，如用N2或其他惰性气体在水箱顶部空间进行保护，可以防止二氧化碳污染纯水水质。

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