广州市港航工程研究所机构成立于2006年9月，前身为广州航海高等专科学校现广州航海学院港航工程设计研究所，是教师对外开展实践和科研的平台。2010年末，以老旧码头检测、评估、技改设计等业务为支撑，率先在校内改革成立**个实体机构，自负盈亏、自担风险，开始高等教育办学模式改革的探索和实践。2012年末，条件具备，正式成立独立法人单位，注册资金100万元人民币，更名为广州市港航工程研究所。